オビトとマダラが起こした第四次忍界大戦、うちはサスケとの争いが終わり、ナルトとサスケは二代火影となった。
その翌日から、ナルトは体調を崩し、サスケはナルトの代わりに火影の役目をこなしていた。
ナルトの体調の変化を異変に感じたサスケは、密かにうちはの壊れた社に行き、遺跡の奥にある写輪眼から読める秘石を読む。
その中に、うちはマダラが説いた神樹なるものが関係していると知る。
しかし、突如、世界各地で巨大な大地震が起きる。世界が暗闇に飲み込まれていく光景が外の世界で起こり始める。
『うちはサスケさんですね？』
黒い仮面をした何者かは、大きな鎌を振るい、サスケの何かを斬る。
サスケはその場に倒れ、サスケは術も何も発動できぬまま何者かの手に堕ちる。
『もうすぐ、うずまき、いや、波風ナルトくんにも、我が同胞が現れる。全ての・・・を・・・ために』
ナルトは外の様子が騒がしいことに気付くが、チャクラの感覚と尾獣である九螺痲のチャクラが反感し合って、ナルトを苦しめていた。
『うずまきナルトくんですか？』
ナルトは横向きで、窓際の方に向いているが、ドア向きの後ろ側に誰かがいた。
【ナルト、かわせ！俺との縁を切りたいのか？】
九尾の九螺痲が中から叫ぶ。だが、ナルトは体調の悪さと術がなぜか練れない感覚で、体が動かず、何者かの都合のよい状態にあった。
何者かは、ナルトのベッドの足を鎌で切り、ナルトはベッドから転げ落ちる。ナルトは黒い仮面をした何者かと顔を合わせる。
『サスケくん、まだ憶えていますか？』
ナルトは記憶を辿り、その名を思い出そうとする。けれど、辿ってきた戦友の姿を思い出せても、顔までは思い出せない。なぜ。どうしてなのか。
『同胞がやってくれたようですね。次は君の番のようですね』
何者かは、黒い球体を手から生み出し、ナルトに見せ付ける。まるで、黒い螺旋丸のようだった。
『さようなら、うずまきナルトくん。君のことは、この世界の君のことは・・・・・・ない』
黒い球体は、ゆっくりとナルトの中に押し込まれる。ナルトは意識が遠のくのを感じる。
『おやすみ。そして、さようなら』
うちはサスケ、うずまきナルトは、何者かの手に堕ちたことを知る由もない。
春野サクラ、奈良シカマル、秋道チョウジ、山中いの、日向ヒナタ、犬塚キバ、油女シノも、もう木の葉の里にはいなかった。
はたけカカシは、誰もいない演習場で、数人の仮面の影と戦っていた。
『あなたの思い出、いや、あなた自身に関わるこの演習場の思い出の場所。周りを見てください』
「見なくても分かっているよ。もうここしか、大切な場所は残されていない。周りは全部暗闇さ」
カカシは、術を発動しようとする際に、チャクラの経絡系が乱れ、動かなくなることを戦いの中で知った。チャクラを練らなければ、体は動かなくなることはないのだ。
「お前たちは何者だ。どうして、暗闇の中でも動ける？」
『・・・のあなたに教えても、無理ですよ』
「何だと？何て言った？」
仮面の影はカカシを円を描くように同胞と囲む。
『・・・ですから。もう、・・・して、・・・にしましょう』
最後の存在、はたけカカシに、影たちの無数の鎌が振るい落とされる。カカシは影の一人を倒して、かわそうとするが、影をすり抜け、暗闇になってない場所に転がる。暗闇の中に行こうとしても、壁のように結界が張っており、逃げ場がなかった。
『我々をあなたと同じにしないでもらいたいのです。さあ、これでさようならです』
暗闇ははたけカカシだけを囲む。もう動けない。カカシには味方はいない。孤独の英雄。
『最後の英雄、はたけカカシさん。おやすみ、さようなら』
世界は暗闇に飲み込まれた。一つの歴史が葬られた。何者かによって。誰もいない。
ー第二話に続くー