ブレスオブファイアⅠの主人公リュウとヒロインであるニーナの間に生まれた男の子、リュウJr.（リュウちゃん）と、ギリアムの子、ギリアムJr.（ギーちゃん）は、キャンプ中にひょんなことからブレスオブファイアⅡの世界へとやってきた。
そこで2人はノルカという少女と出会い、3人で彼女の両親を探す旅に出た。
その途中、いくつかの事件に遭遇しながら、両親の捕えられているデセオ山のところまでやって来た。
しかし、ノルカちゃんが目の前で消えてしまい、さらにディースから信じがたい事実を伝えられてしまう。
そんな大変な状況の中で、2人は最後まであきらめずにノルカちゃんの両親を救い出そうとするが…。
あれから1年2ヵ月後、リュウちゃんは剣の大会に、ギーちゃんは弓の大会に参加した。
その帰り道、彼らはディースと再会した。
彼女はリュウちゃんとギーちゃんに会いたいという人達を引き連れていた。
その人達は…。
（この作品の第1話はコミック本のストーリーが完結した直後のシーンで、第2話からは1年2ヵ月後になります。）
そこで2人はノルカという少女と出会い、3人で彼女の両親を探す旅に出た。
その途中、いくつかの事件に遭遇しながら、両親の捕えられているデセオ山のところまでやって来た。
しかし、ノルカちゃんが目の前で消えてしまい、さらにディースから信じがたい事実を伝えられてしまう。
そんな大変な状況の中で、2人は最後まであきらめずにノルカちゃんの両親を救い出そうとするが…。
あれから1年2ヵ月後、リュウちゃんは剣の大会に、ギーちゃんは弓の大会に参加した。
その帰り道、彼らはディースと再会した。
彼女はリュウちゃんとギーちゃんに会いたいという人達を引き連れていた。
その人達は…。
（この作品の第1話はコミック本のストーリーが完結した直後のシーンで、第2話からは1年2ヵ月後になります。）
| ステージ1: 帰還 | |
| ステージ2：時は流れて | |
| ステージ3：眠る少女 | |
| ステージ4：時空を越えて | |
| ステージ5：Together | |
| ステージ6：運命のいたずら | |
| ステージ7：もしも願いがかなうなら | |
| ステージ8：約束しよう | |
| 追記 |