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科学では解明不能な神秘の生物「携帯魔獣＝ポケットモンスター」。
かつて人間と魔獣は共存の道を歩んでいたが、
20XX年、その歪な平和は限界を迎えた。
人間は魔獣を友と呼ぶ裏で、戦争やテロの兵器として酷使し、
無慈悲な環境破壊によって彼らの故郷と家族を奪い去った。
生存の淵に立たされた魔獣たちは、ついに人類への絶望を募らせ、全世界規模で「共鳴」を開始。
種としての生死を賭けた「叛乱戦争」を宣言する。
しかし、人間を信じ、共に暮らす道を選ぼうとする魔獣たちには戦う意思はなく、
戦火は人間対魔獣のみならず、思想を分かつ魔獣同士の凄惨な同族殺しへと発展していく。
弱き者は淘汰される――自然界の絶対零度の掟のもと、
地球上の全生命と文明の存亡を懸けた終末の戦いが、今ここに幕を開ける。
| 第一話－魔獣の戦い－ | |
| 第二話－夜を照らす炎－ | |
| 第三話－開戦の狼煙－ | |
| 第四話－共鳴の双星－ | |
| 第五話－存亡の戦い－ | |
| 第六話－心の旅路－ | |
| 第七話－青空少女－ | |
| 第八話－炎対水－ | |
| 第九話－紅蓮の博打－ | |
| 第十話－氷砕－ | |
| 第十一話－母と娘－ | |
| 第十二話－暗涙－ | |
| 第十三話－銀竜の矜持－ | |
| 第十四話－鋼蛇の咆哮－ | |
| 第十五話－零度の断罪－ | |
| 第十六話－蒼き守護者－ | |
| 第十七話－氷解の朝－ | |
| 第十八話－断崖の略奪者－ | |
| 第十九話－破壊の足音－ | |
| 第二十話－殺戮兵器－ | |
| 第二十一話－蒼き救世主の奔流－ | |
| 第二十二話－三色の結束－ | |
| 第二十三話－雷神の凱旋－ | |
| 第二十四話－鋼鉄の葬列－ | |
| 第二十五話－拡大する戦火－ | |
| 第二十六話－戦慄のハイウェイ－ | |
| 第二十七話－沈黙の軍隊－ | |
| 第二十八話－隠蔽された敗北－ | |
| 第二十九話－雷鳴の強襲－ | |
| 第三十話－黄金の意志－ | |
| 第三十一話－神話の終焉－ | |
| 第三十二話－崩壊する世界秩序－ | |
| 第三十三話－戦士たちの誓い－ | |
| 第三十四話－天地鳴動の開戦－ | |
| 第三十五話－分かたれた宿命－ | |
| 第三十六話－閃く爪と凶刃－ | |
| 第三十七話－海戦の人魚姫－ |