内容は第２部終了時点でのものになります。
今更ながら登場人物紹介
☆☆ 特設水上機母艦「神川丸」 ☆☆
○一崎天音（ひとさきあまね）
本編主人公。１３歳。身長１４３ｃｍ。髪はこげ茶色のボブヘアー。
階級は一等飛行兵曹（軍曹）。出身は伊豆。使い魔は黒豹。使用機体は水上爆撃脚「瑞雲」を予定している。
現在世界唯一の固有魔法「水中探信」の使い手。魔法波の波長が普通のウィッチより異常に長く、陸・空ともストライカーユニットを動かせられないことや、海にネウロイが出てこないといったこともあり、これまで軍隊に取られることがなかった。しかし潜水型ネウロイの登場でいよいよ海軍に召喚された。横須賀航空隊の横川和美が教官であり師匠である。
地元の漁では漁船を魚群に導いて大漁をもたらしていた「水中探信」であるが、対潜水艦訓練を経て、その探知能力たるや最大１５ｋｍ先の潜水艦を探知することもあり、深度、速度、針路を瞬時に計測するのみならず、表面の様子から内部の構造まで見透かすことができる。複数の魔導探信波を駆使して、現代のソナーでも支障となる水温、塩分濃度、シャドーゾーンといった障害もまったくものともしない。
性格は温厚。努力家。切れると怖い。意外とギャンブラーである。
○筑波優奈（つくばゆうな）
天音の中学同級生。１３歳、身長１４８ｃｍ。栗色の肩まである髪を左右にしばっている。
階級は一等飛行兵曹（軍曹）。出身は伊豆で、天音の隣村の出。使い魔はハクビシン（尻尾が全て真っ黒）。使用機体は零式水上偵察脚。
マラソンが得意で“体力お化け”と言われるほどのスタミナを持ち合わせており、固有魔法ではないが通常の２倍の航続距離を出すことができる。
性格は明るくて楽天家。中学に入ってすぐ魔法力が発現し、海軍にスカウトされた。
入隊後、海軍のおいしい食事にありついたせいか、お胸が急激に発達して天音に驚かれている。
○下妻千里（しもづませんり）
１５歳。身長１５５ｃｍ。髪は紫がかった黒のショートヘア。体系は華奢でスレンダー。
階級は上等飛行兵曹（曹長）。出身は上州。使い魔は雀。使用機体は二式水上戦闘脚。
静かで落ち着いた雰囲気。だが空を飛ぶと言動態度はそのままで飛行が派手で過激になり、“静かなる暴走族”と言われている。
痩せているが相当の大食漢＆早食いで、おひつをご飯茶碗にするほど。
固有魔法はなく、固有魔法持ちのエリートに対し少し劣等感がある。腕や度胸は非常によく、天音が捉えた水中のネウロイを的確に爆撃する。扶桑で最初に潜水型ネウロイを撃沈した。
○卜部ともえ（うらべともえ）
２２歳。身長１６５ｃｍ。黒髪のロングヘア。
階級は少尉。出身は下総。使い魔はホンドタヌキ。
第４２７航空隊の飛行隊長。現在は零式水上偵察機の操縦士。
ほぼあがりを迎えたウィッチだが、まだ飛ぶくらいはでき、水上ストライカーユニット使いとしては一目置かれている。直前まで使っていた機体は零式水上水偵脚。男気で豪快な雰囲気。あまり深いことは考えないので、いい加減な行動を取っているように見られがちである。
○勝田佳奈子（かつたかなこ）
２２歳。身長１５４ｃｍ。セミロングのストレートな黒髪を左に束ねている。
階級は飛行兵曹長（准尉）。出身は甲州。使い魔は甲斐犬。
第４２７航空隊で現在は零式水上偵察機の通信士兼機銃手。
ほぼあがりを迎えたウィッチだが、まだ飛ぶくらいはでき、卜部と同じく水上ストライカーユニット使いとして一目置かれている。直前まで使っていた機体は零式水上観測脚で制空担当だった。二十歳過ぎとは思えない軽い乗りと子供っぽさが特徴。
○葉山（妹）
２１歳。身長１５６ｃｍ。髪はベリーショート。
階級は少尉。１２航戦の対潜指揮官。海軍水雷学校の出身。
ウィッチでもないのにウィッチ隊と対潜水型ネウロイ戦指揮官として配属されたのは、ウィッチの活躍を快く思ってない上層部の力が働いたためらしい。通常は神川丸で指揮を執るが、零式水偵に乗って最前線から指揮する時もある。
生真面目だが不器用。双子の兄がいる。
○有間大佐
神川丸艦長。無精髭を生やし、しゃがれ声で、どんな状況下でも不敵な笑みを絶やさない。
○一宮少年
１４歳。神川丸の整備兵。階級は２等兵。フルネームは一宮翔平（いちみやしょうへい）。武州出身。
父親が神川丸の整備班長だったが、アリューシャン作戦後のドック入りの時に腰を痛めて下艦したため、代わりに乗艦した。
一宮がネジを締めると性能がアップすると言われるほどの高い整備力の血を引いている。実家はあらゆる機械の修理屋で、一宮少年も車のエンジンなどに精通している。
一宮少年を古参兵が虐めるのに天音が激怒してから、天音とはお互い気になる間柄になったようで、度々夫婦漫才を繰り広げている。
☆☆ 第２２駆逐隊とその艦長達 ☆☆
神川丸を直衛する睦月型駆逐艦４隻で構成される。
艦長はみな二十歳過ぎであがり間近の水雷ウィッチ。扶桑海事変直後の募集で海軍に入隊している。
水雷ウィッチは酸素魚雷との相性が抜群に良く、発射する魚雷は海上すれすれをミサイルのように飛び、１発で戦艦を轟沈させる威力を持つ。だがネウロイが海に出てこなかったため、日の目を見ることなく多くの水雷ウィッチが既に引退している。
○駆逐艦「皐月」艦長
飯野五月女（いいのさつき）。階級は少佐。
容姿、性格とも艦これの皐月そのまま。
○駆逐艦「長月」艦長
高山穂長（たかやまほなが）。階級は少佐。
容姿、性格とも艦これの長月そのまま。
○駆逐艦「文月」艦長
長倉秋初（ながくらあきは）。階級は少佐。
容姿、性格とも艦これの文月そのまま。
○駆逐艦「水無月」艦長
磯部あやめ（いそべあやめ）。階級は大尉。
容姿、性格とも艦これの水無月そのまま。
☆☆ ストライクウィッチーズ原作 ☆☆
特に濃く絡んでいる人たち
○横川和美
海軍横須賀航空隊の教官。階級は少佐。
原作ではイラストコラムで飛行学生時代の西沢義子（後のリバウの三羽烏の一人でリバウの魔王）と中間練習脚で飛ぶ姿が描かれている。
本作においては優奈のウィッチ適性検査をした人。同時に天音も検査し、その固有魔法と洗練された能力に目を見張った。潜水型ネウロイが出現したことにより天音をスカウトしに行くとともに、その後の指導に当たっている。天音のウィッチ師匠である。
○竹井醇子
５０４ＪＦＷ戦闘隊長。階級は大尉。
天音が９歳のころウィッチ適性検査をし、その固有魔法の貴重性に気付き、必要となる時が来るまで力を磨いておくようにと告げた。天音が水中探信を洗練させたのはまさに竹井のこの一言があったからである。潜水型ネウロイの出現で真っ先に天音を召喚するよう進言した。
○坂本美緒
５０１ＪＦＷ戦闘隊長。階級は少佐。
竹井や横川から天音の話を聞き、天音がストライカーユニットを動かせられるようにするには、魔導波検波装置のチューニングが肝だとアドバイスした。そしてそのチューニングの為、黒江綾香と連絡を取り、天音のもとに向かわせた。
○黒江綾香
陸軍航空審査部のテストパイロット。「魔の黒江」と恐れられ、坂本とは扶桑海事変で一緒に戦った仲で、アニメ第２期の前に久々の再会をしている。
坂本の連絡を受けて、零式水偵脚が使っている金星系エンジンを持って霞ヶ浦で訓練中の天音を訪れ、実際にストライカーユニットを履かせてチューニングポイントを探り出し、天音に最適なのは金星６型エンジンと瑞雲の組み合わせだと導き出した。
○金子主計中尉
陸軍アフリカ独立飛行中隊「砂隊」の補給や経理等を担当している。「ハナＧ」とのあだ名もある。
潜水型ネウロイの出現で補給が途絶えることをいち早く察知し、武器弾薬は目途をつけたが、扶桑食だけはどうしようもなく扶桑まで戻った。だが物資を持ち帰る手段がなく、アフリカ軍団総司令のロンメル将軍の手を借りて、潜水艦Ｕ－３０８８、その補給船の「アルトマルク」へと荷を載せた。アルトマルクは１２航戦に加わり、第２部末でＨＫ０２船団と共にシンガポールへ無事到着した。第３部を前に北アフリカへ荷を届ける航海へと出発する。
☆☆ その他扶桑組 ☆☆
○葉山（兄）
葉山（妹）の双子の兄。階級は少尉。海軍水雷学校の出身。
入隊前の天音が、水中探信魔法が潜水艦探しに使えるかのテストに立ち会った。
欧州の高い対潜関係技術を学びに欧州へ派遣される予定。
○磐城浅子（いわきあさこ）
１６歳。身長１４０ｃｍ。階級は一等飛行兵曹。
優奈と同期入隊。一家がみな陸軍なので口調が陸軍調の「ｘｘであります！」になっている。その口調から優奈には“陸軍”と言われている。
横川が天音のスカウトに行ったとき、運転手権雑用係りとして同行した。固有魔法はないが、魔力の波動を肌で感じることができ、天音の魔導波の波長が普通のウィッチと違って周期が異様に長いことを突き止めた。
天音のサイン色紙第１号にしてキスマーク入りのものを秘蔵している。葉山（兄）と共に欧州へ向かう予定。
○千早艦長
潜水艦「伊４０１」の艦長。階級は中佐。
アルペジオの群像ほど若くはないが、かなりの若手にして卓越した指揮能力を持つ優れた艦長。
○霧間伊緒菜（きりまイオナ）
階級は少尉。容姿、性格ともアルペジオのイオナそのまま。
潜水艦「伊４０１」搭載の水上攻撃脚「晴嵐」を駆るウィッチ。
○西條中尉
航空巡洋艦「最上」搭載の水上爆撃脚「瑞雲」を駆るウィッチ。
容姿、性格とも艦これの最上そのまま。
○鹿島少尉
練習巡洋艦「香椎」搭載の零式水上偵察脚を駆るウィッチ。
容姿、性格とも艦これの鹿島そのまま。
☆☆ ブリタニア連邦海峡植民地軍 ☆☆
いわゆるシンガポールのブリタニア軍。
○シィーニー・タム・ワン
１４歳。身長１４４ｃｍ。
階級は軍曹。シンガポール航空隊に所属するマレー人植民地兵。使い魔はハクビシン（尻尾は黒で先端が白い）。
使用機体は第２部時点で複葉戦闘脚の「グラディエーターＭｋⅡ」と夜間戦闘脚「ボーファイター」。
欧州のウィッチ不足のためブリタニア人ウィッチは本国へ帰還してしまったため、シンガポールの空の防衛は彼女の一手にかかっている。が、渡される機体はボーファイターが来るまで複葉脚ばかりで、ブリタニア兵からは雑に扱われるしと、植民地兵の悪待遇下で必死にマレーを守っている。
世界で初めて潜水型ネウロイを撃沈した。が、陸上で動けないところに爆弾を仕掛けて沈めたことと、植民地兵だったことから名前も伏せられており、まったく名は売れてない。
○バーン大尉
シンガポール航空隊の指揮官。
植民地派遣軍というブリタニア本国に帰ることもできない左遷組にいてやさぐれている。シィーニーをはじめ植民地兵に冷たく当たっているが、決して蔑ろにしているわけではなく、シィーニー曰くその言葉は９割の皮肉と１割の真実でできている。
○スミス大佐
ブリタニア連邦海峡植民地軍司令官。本国からも左遷組トップという見られ方をしているが、ブリタニアから心が離れつつある植民地に憂慮しており、シィーニー達植民地兵への気遣いは忘れない。
よく基地を留守にしている。