846年、ウォール・マリア奪還作戦が決行された。調査兵団は小規模ながら北部地域にも派兵を行った。その際、複数の巨人に遭遇し隊は壊滅、撤退を余儀なくされた。分隊長であるベルンハルト・フォルカーは、撤退の殿（しんがり）を請け負った。隊の兵士が悉く捕食され死亡する中、残った三人だけが巨人の手から落ち延び、北部山岳地帯の洞窟を拠点に命を永らえている。
| プロローグ 亡霊部隊 | |
| 第1話 北部調査 | |
| 第2話 敗走 迷走 | |
| 第3話 撤退戦線 | |
| 第4話 臨界逃走 | |
| 第5話 未知の恐怖 | |
| 第6話 生存戦略 | |
| 第7話 Interlude | |
| 第8話 進撃 | |
| 第9話 永訣 | |
| エピローグ 死すれども残るもの |