そう遠くない未来、入り込んだ者が消滅すると噂される「魔の三角海域」“バミューダトライアングル”から滅びたはずの「アトランティス帝国」が浮上。そこから現れた海の生物を模した怪人「アトラス」が世界各国へと襲撃を開始。それは日本も例外ではなかった。
アトラスの襲撃事件を受け、日本政府は特殊防衛省略して“特防省”を設立。封印されていた禁断の戦闘システム“クナイ”を解禁し、アトラスとの戦いへ投入する。
そんな中、特防省で働くことになった大学を卒業したての青年“海塚 忍”はひょんなことからクナイの変身者に選ばれてしまう―――
アトラスの襲撃事件を受け、日本政府は特殊防衛省略して“特防省”を設立。封印されていた禁断の戦闘システム“クナイ”を解禁し、アトラスとの戦いへ投入する。
そんな中、特防省で働くことになった大学を卒業したての青年“海塚 忍”はひょんなことからクナイの変身者に選ばれてしまう―――