西暦2030年。
それは電脳化が一般化され情報ネットワークが高度化する中で、光や電子として駆け巡る意思を一方向に集中させたとしても"孤人"が複合体としの"個"となるまでには情報化されていない時代。
日本政府は複雑化する犯罪に対抗するため、内務省直属の独立防諜部隊として"公安9課"、通称"攻殻機動隊"を設立した。サイバー犯罪の捜査やテロリズムの抑止・検挙、要人警護、汚職摘発など極秘裏の任務は多岐にわたる。
そんな中、とあるゲームのプレイヤーが次々と死んでいくという事件が起きた。何故次々と死んでいくのか。そして見え隠れする"lain"の存在。プロフェッショナルと最高のアマチュアの邂逅は成立するのか。


――――記録によって自己の存在は遍在する――――


Present day……
Present time……
Ahahahaha……
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