原作：東方project
紫が霊夢と幻想郷で出来ていて外の世界でもメリーとして蓮子と出来てる感じでした。
それがバレて騒動になり霊夢と連呼が紫を許してはいるけど許さないフリで結婚してた。

みたいな内容の物を見たのですが検索で見つかりません。情報求めてます。

この板を貼らせて頂いたタイプ・ネプチューンです。
ご協力有難うございます！しかし、まだ残しておくので
「こういうのがあったな」と思われた方は遠慮せずに貼って下さい！

自分も貼っておきます。

あの境界を目指して
作者:ふゆい さんです。
短編ですがとても面白いですし六年前の作品ですが連載する可能性が高いです。
内容は境界恋物語のような時空を超えたハートフル作品になる予定らしいです。

原作：艦隊これくしょん
ブラック鎮守府もので、大和が提督に
なにもいらないから わたしといっしょにいて・・・
という本文があったのを覚えています。
蒼龍が妊娠してしまう話もあったと思います。

提督は最強の艦隊を作るといった目的を持っていたと思います。
タイトルが思い出せないので教えて下さると嬉しいです。

よろしくお願い致します

pixivにありますよ
https://www.pixiv.net/novel/show.php?id=9533589

すいませんもう少し探しました。

・聖杯回収のために黒の組織入りしたぐだ子の話

これもpixiv掲載です。伝説タグがつけられるほど面白いようです。
求められてる小説かわかりませんが、試しに『ぐだ子が｢名探偵コナン｣という特異点を解決する話』をコピペして検索したら、ハーメルンで削除された小説の感想の残しが出て来て、それにぐだ子が黒の組織に入る....とあったので。それだったらpixivで見かけた気がするなと。

・Fate/GrandOrder 変異特異点 仮想迷宮都市米花１

人理修復を終えた後に生じた変異特異点に、ぐだ子がレイシフトする話

これ、ですかね?
ただ「腐や夢の要素はない」という断りは見えませんでした。ハーメルンの作品でしょうか? この作品が載せられてるのはpixivです。名探偵コナン×Fateのクロスオーバーはpixivで多く見かけます。何となく内容説明に既視感あったのでpixivで探してみましたが....。

原作はFateだったか、名探偵コナンだったか忘れたので書いていません。

以前、ランキングにも乗っていた事、そして1話のまえがき？あとがき？に「腐や夢の要素はない」と書かれていたことを覚えてます。

久しぶりにあれが読みたいなぁと探してみても、見つからず…
どうか、見つけていただけないでしょうか。

寒い日の暖炉ってサイトの「ハネムーン・デイズ」
http://nonokosu.nobody.jp/
「小説置き場」のアイコンから入り下の方にリンクあります。完結済み

とある姉サイヤ人の日記　《本編完結》
　ドラゴンボール、女オリ主×原作キャラ。

気付いたら赤木しげるの娘だったんですが、
　女オリ主×原作キャラ。恋愛要素はおまけ程度。

智慧と王冠の大禁書
　Fate、女オリ主×原作キャラ。

私のヒーローと世界の危機と愛しい日常風景
　ワンパンマン、女オリ主、逆ハー？

赤座真理恵は《魔法使い》
　落第騎士、女オリ主×原作キャラ。

やはり私と同中の彼との青春ラブコメはまちがっている。
　俺ガイル、女オリ主×原作キャラ。

PERSONA3　Re；venger
　ペルソナ、ヒロインの一人がオリキャラ。

恐らくそれは小説家になろうに投稿されていたものだと思います。天龍とかに昔のトランジスタ詰め込んだり、ak47を制式採用したりするものですかね。確か2016年くらいに消えていたと思います。作者が退会したとかで…
一応urlは貼っときます、もう無いですが。

大日本帝国は沈まず
http://ncode.syosetu.com/n5974ci/