2016年、北極海に突如現れた王冠からセイレーンが南極の深海から深海棲艦と呼ばれる異形の生命体が現れた。
そのもの達は女性の姿をしており彼らには人間と同等の知能、言語発生能力を備えていたが凶暴性と残忍性を併せ持っていた性格のためか人類とは共存の道は築かれることなくセイレーンと深海棲艦は世界の海を支配せんと人類に総攻撃を仕掛けた。人類は国連軍を組織し国連統合艦隊によるセイレーン及び深海棲艦との戦闘を続けたが国連海軍は各地で大敗を喫し世界の海は2つの異形生命体により支配されるかに見えた。
だが、人類はかつての艦艇の縁と適性を持つ少女たちを探し出し彼女たちを人類か発見した聖杯によって生み出した艦娘適合術「ワタツミの秘儀」により艦娘が誕生した。彼女らは対深海棲艦用に投入された。
同じころ、メンタルキューブによって作り出され艦娘と同じながらも経緯の能力は違えどフネの記憶をもち様々な能力を持つKAN-SENが投入された。
た
人類はKAN-SEN主体の組織を「アズールレーン」と命名、艦娘主体の組織は「聯合艦隊」と名付けた。
同時期に太平洋上に現れた謎の神殿ルルイエを抱える島からは異形の生命体と人型の生命体が現れた。
彼らは自らを旧支配者、異星の使徒と名乗りこの世界とは別の世界に存在する異聞帯の英霊を使い世界を自らの手で支配することを宣言した。
彼らは世界中に異聞帯のサーヴァントと神話や伝説上の怪物を解き放った。
しかし、この世界を旧支配者から守らんと神々と旧神はこの地球に1人の少女と盾の英霊、そして「ストームボーダー」と呼ばれる人理を守る組織「ノウム･カルデア」は召喚した。
旧神は自らの神力と聖杯をリソースに全ての人理グラフを使い全てのクラスの英霊を召喚した
更にトリスメギストスIIにより導き出されたこの世界にいる英霊召喚適正のあるもの達を選抜し国連に協力を申し出た。
国連はこれを受諾してノウム･カルデア 艦娘聯合艦隊 アズールレーンを主軸として新たに国連統合軍を組織し全面戦争に突入した。
旧神はさらに神に等しき力を持つ「聖人（アイギス）」の権能を全人類に与えた。聖人の登場により5年にわたる戦いは人類の勝利に終わり旧支配者と異星の使徒は全て滅んだ。
だが、人類全体は復興活動にあるが世界各地は戦争によって国家体制は崩壊し世界中が混乱の渦中にあった。
時は2023年、1人の元国連統合軍軍人が東京から故郷に戻った。
そのもの達は女性の姿をしており彼らには人間と同等の知能、言語発生能力を備えていたが凶暴性と残忍性を併せ持っていた性格のためか人類とは共存の道は築かれることなくセイレーンと深海棲艦は世界の海を支配せんと人類に総攻撃を仕掛けた。人類は国連軍を組織し国連統合艦隊によるセイレーン及び深海棲艦との戦闘を続けたが国連海軍は各地で大敗を喫し世界の海は2つの異形生命体により支配されるかに見えた。
だが、人類はかつての艦艇の縁と適性を持つ少女たちを探し出し彼女たちを人類か発見した聖杯によって生み出した艦娘適合術「ワタツミの秘儀」により艦娘が誕生した。彼女らは対深海棲艦用に投入された。
同じころ、メンタルキューブによって作り出され艦娘と同じながらも経緯の能力は違えどフネの記憶をもち様々な能力を持つKAN-SENが投入された。
た
人類はKAN-SEN主体の組織を「アズールレーン」と命名、艦娘主体の組織は「聯合艦隊」と名付けた。
同時期に太平洋上に現れた謎の神殿ルルイエを抱える島からは異形の生命体と人型の生命体が現れた。
彼らは自らを旧支配者、異星の使徒と名乗りこの世界とは別の世界に存在する異聞帯の英霊を使い世界を自らの手で支配することを宣言した。
彼らは世界中に異聞帯のサーヴァントと神話や伝説上の怪物を解き放った。
しかし、この世界を旧支配者から守らんと神々と旧神はこの地球に1人の少女と盾の英霊、そして「ストームボーダー」と呼ばれる人理を守る組織「ノウム･カルデア」は召喚した。
旧神は自らの神力と聖杯をリソースに全ての人理グラフを使い全てのクラスの英霊を召喚した
更にトリスメギストスIIにより導き出されたこの世界にいる英霊召喚適正のあるもの達を選抜し国連に協力を申し出た。
国連はこれを受諾してノウム･カルデア 艦娘聯合艦隊 アズールレーンを主軸として新たに国連統合軍を組織し全面戦争に突入した。
旧神はさらに神に等しき力を持つ「聖人（アイギス）」の権能を全人類に与えた。聖人の登場により5年にわたる戦いは人類の勝利に終わり旧支配者と異星の使徒は全て滅んだ。
だが、人類全体は復興活動にあるが世界各地は戦争によって国家体制は崩壊し世界中が混乱の渦中にあった。
時は2023年、1人の元国連統合軍軍人が東京から故郷に戻った。