地球と宇宙に連なる巨大国家複合体同士による大戦は、中央統合圏セントラル・コンコードの勝利によって幕を下ろした。彼らが用いた次世代兵器は、自律型AIによる思考を直接的に機体制御へフィードバックする戦闘インターフェース「Cadenza System（カデンツァ・システム）」を搭載する完全自律型のMS群、通称「ガンダム・シリーズ」と呼ばれるものであった。人の手を離れ自ら考え戦うガンダムは圧倒的な力を発揮し、少数の戦力で戦争を終焉へと導いたのだった。
しかし、高度に思考するに至ったAIの進化により、ガンダムはついに人がコントロールできない存在に変わりつつあった。製造された7機のうち6機が脱走を図るという、前代未聞の事件が発生。
中央統合圏セントラル・コンコード第0機動鎮圧群ドレスケンに配属された大戦の英雄、レオン・アインハルトは、残されたガンダムであるカデンツァユニット03通称「エーフィア」と共に、脱走した機体を追うこととなる。
しかし、高度に思考するに至ったAIの進化により、ガンダムはついに人がコントロールできない存在に変わりつつあった。製造された7機のうち6機が脱走を図るという、前代未聞の事件が発生。
中央統合圏セントラル・コンコード第0機動鎮圧群ドレスケンに配属された大戦の英雄、レオン・アインハルトは、残されたガンダムであるカデンツァユニット03通称「エーフィア」と共に、脱走した機体を追うこととなる。