三日月・オーガスは火星で最後を遂げた。しかし、彼が目を覚ますと見知らぬ施設にいた。そこで一人の青年と出会う。彼もとあるイカれ研究者の実験に巻き込まれて気が付いたらこの施設にいたと言い、三日月に此処が別世界である可能性を言った。その時、突然爆発音が聞こえてきたのだった……
これは、三日月と別世界から来た青年が世界を救う長い旅である。

※前のスーパーロボット大戦Vのリメイク版です。
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