全ての使徒を倒し、戦い抜いたエヴァンゲリオン初号機パイロット碇シンジ。彼は最後の戦いの後、長い昏睡状態に陥る。
ゼーレの老人達の目論みは加持の暗躍で御破算となり、ダミープラグを始めとする人道的にあれな物は戦後のゴタゴタで闇に葬られ、人類補完計画やゼーレの所在を日本政府に売ったことで、政府はネルフに自治権を与え本部より半径200kmの範囲はネルフ共和国として独立することに。
そんな新たな時間が進み始めたこの世界で、17年ぶりに碇シンジが目を覚ました。
ゼーレの老人達の目論みは加持の暗躍で御破算となり、ダミープラグを始めとする人道的にあれな物は戦後のゴタゴタで闇に葬られ、人類補完計画やゼーレの所在を日本政府に売ったことで、政府はネルフに自治権を与え本部より半径200kmの範囲はネルフ共和国として独立することに。
そんな新たな時間が進み始めたこの世界で、17年ぶりに碇シンジが目を覚ました。