ピュアーズロックを飛び出したミュウツーは果ての無い世界へと旅立っていく。そんな彼を待ち受けるのは一体！？そして旅の中でミュウツーは何を思い、何を見ていくのか！？
そんなミュウツーと旅を共にする唯一匹のポケモン。それはミュウツーにとって己の全てを物語る存在でもある『ミュウ』だった。そんな二匹に迫るポケモンハンターの魔の手が！？
旅の中でミュウツーは決して明かされる事の無かった禁断の過去を知る事となる。
果たしてその内容とは--
そんなミュウツーと旅を共にする唯一匹のポケモン。それはミュウツーにとって己の全てを物語る存在でもある『ミュウ』だった。そんな二匹に迫るポケモンハンターの魔の手が！？
旅の中でミュウツーは決して明かされる事の無かった禁断の過去を知る事となる。
果たしてその内容とは--