殺せんせーがE組の担任になる前のある日、彼が出会ったのは神様を名乗る不思議な少女だった。

神様少女が暗殺教室の生徒たちと触れ合い、得る物は何か。その瞳に映る暗殺教室の未来はどんなものなのか