神に守護され、緩やかな滅びを待つだけの、小さな箱舟のような世界がある。何かに呼び寄せられたかのように、遥か彼方から光の巨人がやってきた。

人類の天敵は壁の外から攻めてくるバーテックスだけではない。バーテックスと同じく世間にはその存在を隠されている存在、通称『怪獣』。

これは人類の敵と戦う勇者たちと光の巨人の物語。

神に見初められた無垢な少女たちは過酷な運命にその身を投じていく。