秘めたる想い・交わる心

ガメラとレギオンの戦いから3年後の1999年、被害にあい両親を失った柳星壱輝は親戚の家に預けられ、南明日香村に住むことになった、壱輝はこの村で激しい戦いの渦に巻き込まれていく。