千歌と曜とルビィと悪斗は九州へ旅行するために博多から10時43分発の特急「かもめ11号」に乗って長崎へ行く事になった、ところが車内のトイレで男性の死体が発見された。そして特捜班はこの事件の謎を解くのだが謎を解けるのか。

西九州新幹線開業記念作品