西暦2045年。GFハウス第2プラント。
10歳のアクアはハウスの真実を知り、最愛のママ・アイを欺く命がけの脱獄計画を開始する。
一方、壁の向こうの第3プラントでも、エマやレイ達が絶望のなかで牙を研いでいた。事前連絡一切なし。
お互いの存在すら知らぬまま、同じ日の同じ時刻、壁の頂点で二つのプラントの天才たちが出会う――。