日本における裏世界、暗部への対策として
昔から存在する名家『明智』。分家は全部で13家に及ぶ。
その明智家本家の長男として生まれた少年、
【明智零也】は武偵として事件へ対処をしながら表の日々を送り、
裏ではテロリストへの対処をする生活を幼少時から過ごしていた。

だが、そんな零也が2年生となった年度の始業式の日。
とある少女と出会った事で彼の生活には一つの変化が訪れる
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