自衛隊は縮小しており艦娘がいる日本で期間限定海域を突破した佐世保鎮守府。
艦娘や深海棲艦なんておらず自衛隊が存在するもう一つ別の日本では大規模演習のため多数の自衛隊員が九州に集っていた。

それらの組織が神(エラー娘)によって過去の日本に飛ばされた。
しかも史実とは異なりこの日本はいまだ太平洋戦争が継続している。

日本を降伏させたい米軍を含む連合軍はダウンフォール作戦の一環であるコロネット作戦を立案、まもなく決行されようとしていた。

見たことない援軍に怪しむもそれどころではない旧日本軍。これは神風が吹いたと。しかし話を聞くとどうも複雑な事情を抱えていた。しかし連合国軍の上陸まであとわずか……。

憲法9条、専守防衛、ポジティブリスト、自衛隊法などに縛られた自衛隊はどう対応する?

連合国艦娘を抱えている佐世保鎮守府は協力するのか?