人類はラプチャーという名の機械生命体により滅亡の危機に瀕していた。少女達の脳髄を利用した人型兵器"ニケ"により抵抗するも、圧倒的な物量の前に徐々に追い詰められていった。そんな中、ゴッデス部隊のレッドフードは早乙女研究所でゲッターロボと出会う。これは人類のために戦うニケたちと彼女たちが駆るゲッターロボの物語。