"大海賊時代"開幕以来最大の戦い、『マリンフォード頂上戦争』は、数多の命の散り華として幕を閉じた。そして戦争の引き金となった男、火拳のエースは恩人白ひげと共に死んだと思われた。だが、運命は彼の死を受け入れない。死んだはずのエースが再び目を開けると、そこには一人の少女とフェレットが自分を見つめていた。『魔法少女リリカルなのはACE』、堂々の開幕っ！！
| プロローグ | |
| 無印編 | |
| 第一話 邂逅 ～ 共鳴する願い | |
| 第二話 目覚めと生存 ～ 新たな世界 | |
| 第三話 温かなる友 ～ 胎動 | |
| 第四話 お茶会 ～ 変わり出す日常 | |
| 第五話 もう一人の魔法少女 ～ 出会いは突然に | |
| 第六話 新たな相棒と温泉旅行 ～ 誓いの印 | |
| 第七話 相対 ～ 束の間の安らぎ | |
| 第八話 二度目の邂逅 ～ 真夜中の決闘 | |
| 第九話 葛藤と友情 ～ 託すものと託されるもの | |
| 第十話 激突する想い（前編） ～ 覚悟と信念 | |
| 第十一話 激突する想い（後編） ～ 起動する覚悟 | |
| 第十二話 偉大なる証 ～ それぞれの思い | |
| 第十三話 出会いと必然 ～ 次元の海へ | |
| 第十四話 潜入Ⅰ ～ すれ違う者達 | |
| 第十五話 潜入Ⅱ ～ 母の定義 | |
| 第十六話 真実の断片 ～ 求める心と怒れる魂 | |
| 第十七話 夕暮れの決闘 ～ 乱入者 | |
| 第十八話 時空管理局 ～ 信念と願い | |
| 第十九話 契約と約束 | |
| 第二十話 海に生きる者（前編） | |
／連載：4話／更新日時：2026年05月07日(木) 00:04 
／連載：7話／更新日時：2026年05月20日(水) 17:19 
／連載：88話／更新日時：2026年06月07日(日) 22:37 
／連載：108話／更新日時：2026年07月06日(月) 10:00