これはポケモンマスターを目指すサトシがサクラギ研究所のリサーチフェローを終えてバトルフロンティアのフロンティアブレーンとしてバトルしながらポケモンワールドチャンピオンシップの頂点ダンデに挑むための物語である。
| 設定資料 | |
| 設定 | |
| 設定2 | |
| 本編 | |
| 新たな冒険 | |
| ダンデ VS キバナ ライバル対決! | |
| さすらいのカモネギ!! | |
| ヨロイ島上陸! | |
| 第一の修行 | |
| フロンティアブレーンのバトル! サトシVSシンジ!! | |
| 小さな格闘家ダクマ | |
| がっちゃんこで復活! ガラルの化石ポケモン!! | |
| ザシアンとザマゼンタ | |
| ダクマとサトポケ | |
| リザードンとゼクロム! 新たな力! | |
| ダクマの初バトル! 超えるべき壁! | |
| 最強のライバルと猛火 | |
| ピカチュウ覚醒!WEB騎士ゴー! | |
| グラディオンピカチュウ VS ガラルファイヤー !! | |
| 挑戦!双拳の塔!! | |
| メガ島! メガストーンを求めて!! | |
| 凶悪再来!ウェブナイツ出撃! | |
| ダイミツを探せ!ウーラオスのキョダイマックスへの道!! | |
| ウーラオス!キョダイマックス対決!! | |
| ドラゴン対決!サトシvsアイリス!! | |
| 修行の終わり!新たな境地へ!! | |
| カンムリ雪原到着! | |
| 豊穣の王!バドレックス! | |
| 伝説の愛馬とニンジン! | |
| 荒ぶる愛馬!フリーズ村を守れ! | |
| ウーラオスダブル出撃!VSブリザポス&レイスポス! | |
| カンムリ神殿へ!取り戻せ愛馬との絆! | |
| サトシ VS デンジ!!ハイパークラスバトル!! | |
| 四神ポケモン現る!(前編) | |
| 四神ポケモン現る!(後編) | |
| ガラル三鳥集結! | |
| 対決!ガラル三鳥! | |