ガトランティス戦役後の2204年、地球連邦防衛軍では時間断層破棄までに建造された無人艦艇の破棄に悩みがあった。そこで防衛軍は無人艦を有人化し練習艦及び有人艦にする事に決定。そして冥王星基地に新たな波動砲艦隊となる部隊を駐屯させる事になる。その中にはガトランティス戦役で撃沈されたはずの艦の姿もあった。しかし突如としてその冥王星基地所属の波動砲艦隊が消息不明となる。そして消息不明となった艦の乗組員の運命はいかに