幻想郷に突如ポケモンが流れ着いた。賢者八雲紫はそのポケモンを使って幻想郷の住人達にポケモンバトル祭りを開催することを発表した。お馴染みのメンバーから意外なポケモンまで登場して白熱したバトルが始まる！
| 第一話 最初のポケモン | |
| 第二話 問答無用の楽園の素敵な巫女 | |
| 第三話 コミュニケーション | |
| 第四話 ルール説明 | |
| 第五話 バトル、開始 | |
| 第六話 四季映姫vs小野塚小町 | |
| 第七話 瓔花の異変と嫉妬のパルスィ | |
| 第八話 最初の勝利チーム | |
| 第九話 幻想郷のジョーイさん | |
| 第十話 エースバーンvsマフォクシー 前編 | |
| 第十一話 エースバーンvsマフォクシー 中編 | |
| 第十二話 エースバーンvsマフォクシー 後編 | |
| 第十三話 仙人と仙人 | |
| 第十四話 青娥と青娥 | |
| 第十五話 鳩鶏鴉駒 | |
| 番外編１ ウツロイド追跡隊vsレジロック | |
| 第十六話 博霊神社の決闘 | |
| 第十七話 エスパー対決 | |
| 第十八話 最弱のポケモンと最強のトレーナー | |
| 第十九話 むしタイプ統一パーティ | |
| 第二十話 vsボーマンダ | |
| 第二十一話 醸し出るカリスマ | |
| 第二十二話 タイプ相性 | |
| 番外編２ ウツロイド追跡隊vsレジスチル | |
| 番外編３ ウツロイド追跡隊vsレジアイス | |
| 第二十三話 二日目の夜明け | |
| 第二十四話 vs二ツ岩マミゾウ | |
| 第二十五話 残り二人 | |
| 第二十六話 幕引き | |
| 第二十七話 重量級 | |
| 第二十八話 柔の戦い | |
| 第二十九話 カウンター | |
| 第三十話 勝ち抜きバトル | |
| 第三十一話 急所と高火力 | |
| 第三十二話 無言の通じ合い | |
| 番外編４ マフォクシーとカロス地方の師匠 | |
| 第三十三話 公平なバトル | |
| 第三十四話 あくタイプ |